1,3-丁二醇有良好的抑菌作用，是各种精油的良好溶剂，可用来制备溶液、乳膏、乳液等。
在推进剂中主要作为扩链剂调节推进剂的力学性能，用于制备聚酯树脂、聚氨基甲酸酯树脂、增塑剂、油墨等
也用作纺织品、纸张和烟草的润湿剂和软化剂。
1,3-丁二醇的毒性与甘油相似，属微毒类物质，对人的粘膜和皮肤无刺激，急性中毒时动物呈深麻醉状。它对高等动物的毒性也很低，低于1，4-丁二醇。
